Les pigments sont extrêmement sensibles à la lumière et à la chaleur. Pour cela il est recommandé de demarrer la filtration le plus rapidement possible après l'échantillonnage afin que les pigments ne se degradent pas ou ne se transforment pas. Dans les cas ou cela est impossible, en attendant il faudrait pouvoir maintenir les échantillons d'eau à filtrer au frais et à l'obscurité.